Президент Института — Председатель Правления Института, заслуженный деятель науки РФ, доктор технических наук, профессор, Почётный гражданин города Серпухова
Генеральный директор — Первый Вице-президент Института, почётный работник науки и техники РФ, доктор технических наук, доцент
Первый Вице-президент Института — Первый заместитель генерального директора, почётный работник науки и техники РФ, кандидат технических наук, доцент
Первый Вице-президент Института — Главный конструктор, почётный работник науки и техники РФ, доктор технических наук, профессор
Главный бухгалтер — Советник Президента Института по финансам, заслуженный экономист Московской области
Вице-президент Института по инновационным проектам, заслуженный изобретатель РФ, почётный работник науки и техники РФ, доктор технических наук, профессор
Вице-президент Института по безопасности, Вице-президент Серпуховской торгово-промышленной палаты, Член Общественного совета при ГУ МВД Московской области
Вице-президент Института по общим вопросам и социальной политике
Вице-президент Института, руководитель обособленного подразделения в Москве
Заместитель генерального директора по защите государственной тайны
Заместитель генерального директора по испытаниям, лауреат государственной премии СССР, почётный работник науки и техники РФ, кандидат технических наук, старший научный сотрудник
Заместитель генерального директора по специальным проектам, доктор технических наук, профессор
Заместитель генерального директора по научно-технической политике и межструктурным коммуникациям, доктор технических наук, профессор
Главный инженер
Советник Президента Института, заслуженный врач РФ, заслуженный врач Бурятской АССР, кандидат медицинских наук
Советник Президента Института, почётный работник высшего профессионального образования РФ, кандидат педагогических наук
Советник Президента Института по правовым вопросам – руководитель юридической службы
Советник Президента Института по медико-биологическому направлению, лауреат премии Правительства РФ в области науки и техники, лауреат первой национальной премии “Призвание. Лучшие врачи России”, почётный работник науки и техники РФ, доктор медицинских наук, профессор