Каждый рабочий день в 12.30 в часовне совершаются молитвы. Группа сотрудников Института по благословению настоятеля часовни священника Алексия Спигина читает акафисты Иисусу Христу, Божией Матери, Ангелу Хранителю и святым угодникам Божиим.
Акафистом называется особый род церковных молитв, которые могут читаться мирянами дома или в церкви. «Неседальное пение» — так переводится слово «акафист» с древнегреческого языка. Это означает, что акафист читают или слушают стоя. Акафист — это хвалебная песнь, торжественный гимн, написанный в честь Иисуса Христа, Божией Матери или святого. Собственно акафист состоит из разных частей: кондаков и икосов. Кондак представляет собой небольшую песнь, кратко описывающую какую-либо историю, связанную со святым. Икос — это тоже восхваляющая песнь, которая более расширенно раскрывает событие, воспетое в предыдущем кондаке.
Прихожане часовни особым образом, нараспев, по очереди читают на церковно-славянском языке по нескольку песен из акафиста, повторяя хором молитвенные припевы в конце каждых кондака и икоса.
Для совершения молитв в часовне имеются книги Акафистов святым, рекомендованные Русской Православной Церковью для чтения на каждый день седмицы. В двунадесятые и особо чтимые праздники для богослужения приглашается настоятель часовни отец Алексий и вместе с прихожанами часовни совершает молебное пение, чтение акафиста и панихиду по усопшим православным христианам. В Праздник Богоявления Господня (Крещения) священником Алексием производится освящение воды, которая затем раздается всем работникам, желающим приобщиться святой благодати.
В Институте сложилась благочестивая традиция: каждое особо важное для жизнедеятельности Института мероприятие предварять усиленной общей молитвой с чтением избранных псалмов из Псалтири. Руководство Института вместе с сотрудниками объединяется для общих прошений милости Божией к нашему Институту.
Прихожанами часовни составлена и согласована с Патриархией РПЦ особая молитва ко Господу Иисусу Христу, Пресвятой Богородице и святым угодникам Божиим, под чьим покровительством находится часовня. Молитва читается ежедневно после чтения акафиста и содержит в себе благодарение Богу за возможность молиться в часовне, иметь работу в Институте и прошение Божией милости ко всем сотрудникам, укрепления и процветания Института на благо Отечества нашего.
Для чтения молитв приглашаются все желающие. Постепенно все больше и больше сотрудников, в том числе и молодых, приходит помолиться о своей душе и на благо нашего Института. В особые церковные праздники, когда службы совершаются отцом Алексием (Спигиным) прихожан набирается столько, что часовня с трудом вмещает всех желающих. Занятые целый день на своих рабочих местах люди рады возможности помолиться, посвятить хотя бы часть своего времени и сил Богу.
Мы верим, что ежедневная молитва, хотя бы самая малая, привлечет Божию благодать ко всем нам и особенно будет способствовать успешному развитию Института на благо России. В сердцах наших живут вера и надежда на то, что наши молитвенные труды, подобно малой лепте бедной вдовы из Евангелия, будут угодны Богу.